肿瘤基因组学共享资源设施(OG SRF)
主任:张树林，医学博士，法医学博士，FCCMGShulin.Zhang@uky.edu
副主任:魏塞南，博士，医学博士Sainan.Wei@uky.edu
使命宣言
肿瘤基因组共享资源设施(OG SRF)实验室的总体任务是通过提供前沿的基因组技术服务，加速马基癌症中心(MCC)的临床基因组学、精准医学和基因组研究兴趣。
作为更大的英国医疗保健基因组学核心的一个组成部分，OG SRF提供了最先进的技术，专门beplay首页适应MCC研究人员的需求，以促进基因组学从基础研究转化为临床和基于人群的研究。OG SRF在Markey的精准医疗研究和交付方向中起着关键作用。
基因组学核心实验室是美国病理学家学院认可的设施，成立于2015年，是英国卫生保健、病理和实验室医学系和MCC基因组学计划的一部分。beplay首页该设施占地约4500平方英尺，位于英国医疗保健临床实验室内。beplay首页
你可以在这里浏览我们的网页，了解我们的团队，找到我们的位置和其他重要信息。欲了解更多，请访问基因组学核心实验室网页．
服务
我们为研究人员提供广泛的基因组服务，包括:
调研平台咨询
OG SRF的专家团队与调查人员合作，选择适合其科学和预算需要的适当研究平台。
在选择第三方供应商之前，强烈建议与OG SRF安排一次咨询，以帮助您为项目选择最佳供应商。选择的依据包括可用的前沿平台、高质量的交付成果以及提供基本的基因组数据解释。
OG SRF与生物统计学和生物信息学SRF密切合作，分析和解释您的数据。点击这里查看生物信息学服务．
新一代测序
DNA测序
- 全基因组测序
- 人类和其他生物
- 我们准备NGS库
- 有针对性的重新排序
- 扩增子测序和小基因板
- 研究者提供探针/扩增子/库
- 全外显子组测序
- 我们准备图书馆
- 安捷伦临床研究Exome
- 罗氏Nimblegen MedExome
- Illumina快速外显子组
RNA序列
- 全转录组测序(RNA-seq)
- 我们准备NGS库/调查人员也可以准备库
- 针对RNA-sequencing
- 调查人员提供NGS库
- 甲基化测序
- 全基因组甲基化测序
- 研究人员可以提供NGS库
- Chip-sequencing
- NGS库的准备和测序
- 调查人员执行IP并提供捕获的碎片
桑格测序
- 第I层-测序
- 研究者进行PCR，测序反应和清理
- 第II层-清理和排序
- 研究者进行PCR和测序反应
- 第三层-桑格测序反应，清理和测序
- 研究者进行PCR
片段分析
- 客户端在ABI 3730上执行反应和片段分析
基因表达微阵列
- 所有标准数组
- microrna的数组
- 自定义数组
其他服务
- NanoString
- Real-time-PCR
- 生物分析法
- Covaris超声用于芯片测序
确认
研究人员必须在使用MCC OG SRF所产生的任何出版物中确认马基癌症中心肿瘤基因组学共享资源设施(OG SRF)。为方便起见，欢迎使用以下声明:该研究得到肯塔基大学马基癌症中心肿瘤基因组学共享资源设施(P30CA177558)的支持。beplay全站官网登录入口
教职员工
主任:张树林，医学博士，法医学博士，FCCMG
病理学和检验医学教授
马基癌症中心肿瘤基因组共享资源设施主任
英国医疗保健基因组学核心实验室主任beplay首页
电子邮件:Shulin.Zhang@uky.edu
查看医生简介
副主任:魏塞南，医学博士，博士
病理学和检验医学副教授
马基癌症中心肿瘤基因组共享资源设施副主任
电子邮件:Sainan.Wei@uky.edu
查看医生简介
Vijaya Sivaraj，博士，MBA
马基癌症中心英国医beplay首页疗保健基因组学核心实验室和肿瘤基因组学共享资源设施经理
电话:859-218-5832
电子邮件:Vijaya.Sivaraj@uky.edu
Jennifer stockas - candelaria, BS, BA, MB (ASCP)CM
总化验师
肿瘤基因组学共享资源设施，马基癌症中心
电子邮件:Jennifer.Stocks-Candelaria@uky.edu
成本结构
MiSeq及下一代图书馆相关服务价目表。
| 服务名称 | 描述 | 英国的价格 | MCC会员价格* |
| Res错误运行2x250 v2 nano | MiSeq Run - Nano 250X 2 Flowcell。仅运行，在运行前可能需要QPCR。 | 900.00美元 | 675.00美元 |
| Res miseq运行2x150 v2 | MiSeq运行-150X2 Flowcell。仅运行，在运行前可能需要QPCR。 | 1205.03美元 | 903.77美元 |
| Res miseq运行2x250 v2 | 运行- 250X2 Flowcell。仅运行，在运行前可能需要QPCR。 | 美元1285 .11点 | 963.83美元 |
| Res错误运行2x300 v3 | MiSeq Run - 300X2 Flowcell。仅运行，在运行前可能需要QPCR | 1664 .71元 | 美元1248 .53点 |
| Res nextera library prep ** | MiSeq Nextera库准备。客户提供DNA | 250.00美元 | 187.50美元 |
| Res nextera xt库准备** | MiSeq Nextera XT库准备。客户提供DNA | 256.00美元 | 192.00美元 |
| Res q PCR用于NGS文库 | NGS的QPCR | 35.00美元 | 26.25美元 |
| 用量子位计算DNA定量 | 每样本量子位的DNA定量 | 2.08美元 | 1.56美元 |
| 按量子比特计算RNA定量 | 每样本量子比特RNA定量。 | 4.27美元 | 3.20美元 |
| Res truseq pcr free library prep ** | MiSeq TruSeq DNA PCR免费文库制备 | 255.00美元 | 191.25美元 |
| Res truseq纳米库prep ** | MiSeq TruSeq DNA文库制备 | 325.00美元 | 243.75美元 |
| Res truseq RNA文库准备** | MiSeq TruSeq RNA文库制备 | 310.79美元 | 233.09美元 |
| Res癌症基因组 | 使用安捷伦SureSelect XT试剂盒和自动化技术制备自定义198基因癌症面板文库。与Illumina HiSeq下一代测序兼容。(有关感兴趣的基因、样本数量和所需覆盖的测序深度，请联系)。 | 559.60美元 | 419.70美元 |
| Res amplicon dnaseqnextera指数 | 利用Nextera指数进行扩增子DNA测序。客户端使用包含Illumina适配器序列、8核苷酸索引序列和基因特异性引物的引物生成16S扩增子。扩增子在Miseq平台上使用2x250碱基读取进行测序。 | 44.67美元 | 33.50美元 |
| Res STR人类细胞系认证 | 使用Promega PowerPlex 16 HS系统结合ABI 3130xl遗传分析仪对客户提供的DNA进行片段分析。对16个短串联重复位点进行碎片化和评估，并使用ABI Gene Mapper为每个STR生成片段分析图。fsa文件和片段分析图都提供给客户端，用于其人类细胞系的ID或认证。 | 63.25美元 | 47.44美元 |
| 分辨率超声单样品 | Covaris超声-剪切/加工一个样品 | 32.00美元 | 24.00美元 |
| 分辨率超声附加样品 | Covaris超声额外的样品将包括一个样品的基本价格每一个额外的样品费用。 | 7.50美元 | 5.63美元 |
| Res tape station RNA | 每样本挂钉RNA分析 | 17.84美元 | 13.38美元 |
| 高灵敏度DNA 1000 | 贴贴法高灵敏度DNA分析 | 16.34美元 | 12.26美元 |
| Res带高灵敏度RNA | 单样品高灵敏度RNA分析 | 18.49美元 | 13.87美元 |
| Res tapestry基因组DNA | 每样本基因组DNA分析 | 16.39美元 | 12.29美元 |
| 记录DNA 1000站 | 贴壁DNA 1000分析/样品 | 15.03美元 | 11.27美元 |
注1:**文库制备只包括生物分析和量子比特成本，不包括QPCR成本35美元。
*会员价格包含25%的补贴。
非英国客户支付标价加10%。
桑格测序相关服务价目表
| 服务名称 | 描述 | 英国的价格 | MCC会员价格* | 笔记 |
| Res sanger测序层1.1 | 测序(运行)，1-16个样本 | 3.40美元 | 2.55美元 | 每一个样品 |
| Res sanger测序1.2层 | 测序(运行)，17-96个样本 | 50.00美元 | 37.50美元 | 单价/车牌 |
| 第2.1层Res sanger序列 | 反应清理和测序，1-16个样品 | 4.22美元 | 3.17美元 | 每一个样品 |
| Res sanger序列在2.3层 | 反应清理和测序，17-96个样品 | 55.00美元 | 41.25美元 | 单价/车牌 |
| Res sanger序列3.1层 | 测序反应建立，清理和测序，1-20个样品 | 9.94美元 | 7.46美元 | 每一个样品 |
| Res sanger测序3.3层 | 测序反应建立，清理和测序，21-60个样品 | 162.83美元 | 122.12美元 | 所有单位的统一价格 |
| Res sanger测序3.4层 | 测序反应建立，清理和测序，61-94个样品 | 195.00美元 | 146.25美元 | 单价/车牌 |
| Res sanger测序3.5层 | 与3.3层+附加底漆相同 | 162.83美元 | 122.12美元 | 1个底漆包含在$162.83中 |
| Res sanger测序层3.6 | 与3.4层+附加底漆相同 | 195美元 | 146.25美元 | 195美元包含1个底漆 |
| Res附加引物 | 每一个附加引物在一个/板上测序是一个单位 | 6.00美元 | 4.50美元 | 每个引物 |
| Res PCR纯化孔板 | PCR纯化井板(94):磁珠 | 149.46美元 | 112.10美元 | 每板 |
| Res PCR纯化 | PCR产物纯化:磁珠制备 | 1.59美元 | 1.19美元 | 每一个样品 |
| Res酶PCR纯化 | PCR产物纯化:酶净化 | 3.31美元 | 2.48美元 | 每一个样品 |
| Res碎片分析板 | ABI 3730上的片段分析(客户端执行反应) | 86.01美元 | 64.51美元 | 每板 |
*会员价格包含25%的补贴。
非英国客户支付标价加10%。
HiSeq相关服务价目表
| 服务名称 | 描述 | 英国的价格 | MCC会员价格* |
| 高输出运行模式 | |||
| Res hop full flow cell sr 100 | HiSeq高输出运行与100 bp单读全流程单元 | 9200美元 | 6900美元 |
| 在1车道sr 100 | HiSeq高输出运行与100 bp单读1 Lane | 1150美元 | 862.50美元 |
| Res hop full flow cell PE 50 | HiSeq高输出运行与50 bp配对结束读全流程单元 | 11261美元 | 8445美元 |
| 预定跳1车道PE 50 | HiSeq高输出运行与50 bp配对结束读1 Lane | 美元1493 .96点 | 美元1120 .47点 |
| Res hop full flow cell PE 100 | HiSeq高输出运行与100 bp配对结束读全流程单元 | 16396 .26美元 | 12297 .20美元 |
| 预定跳1跑道PE 100 | HiSeq高输出运行与100 bp配对结束读1 Lane | 2107 .46 | 1580 .60美元 |
| Res hop full flow cell PE 125 | HiSeq高输出运行与125 bp配对结束读全流程单元 | 16396 .26美元 | 12297 .20美元 |
| 预定跳1跑道PE 125 | HiSeq高输出运行与125 bp配对结束读1 Lane | 2107 .46 | 1580 .60美元 |
| Res hop full flow cell sr 50 | HiSeq高输出运行与50 bp单读全流程单元 | 7000美元 | 5250美元 |
| 保留区，1车道，sr 50 | HiSeq高输出运行与50 bp单读1 Lane | 971.96美元 | 728.97美元 |
| 快速运行模式 | |||
| reseq rr full FLWC sr 50 | HiSeq快速运行与50 bp单读全流量单元 | 1650美元 | 1237 .50美元 |
| Res split FLW cel 2 lane sr50 | HiSeq快速运行与50 bp单读2车道分裂流单元 | 2300美元 | 1725美元 |
| ressplit flow cel 1 lane sr50 | HiSeq快速运行与50 bp单读1车道分裂流单元 | 1150美元 | 862.50美元 |
| Res hiseq rr full FLWC sr 100 | HiSeq快速运行与100 bp单读全流量单元 | 2300美元 | 1725美元 |
| Res split FLW cel 2lanes sr100 | HiSeq快速运行与100 bp单读2车道分裂流单元 | 2700美元 | 2025美元 |
| Res split FLW cel 1 lane sr100 | HiSeq快速运行与100 bp单读1车道分裂流单元 | 1350美元 | 1012 .50美元 |
| resiseq RR全流量电池sr200 | HiSeq快速运行与200 bp单读全流程单元 | 3063美元 | 2297美元 |
| Res split FLW cel 2lanes sr200 | HiSeq快速运行与200 bp单读2车道分裂流单元 | 3549美元 | 2661美元 |
| Res split FLW cel 1 lane sr200 | HiSeq快速运行与200 bp单读1车道分裂流单元 | 1775美元 | 1331美元 |
| reseq rr full flowcel pe50 | HiSeq快速运行与50 bp配对结束读取长度在全流单元 | 3115美元 | 2336美元 |
| Res split FLW cel2lanes pe50 | HiSeq快速运行与50 bp配对结束读取2车道分裂流量单元 | 3601美元 | 2700美元 |
| Res split flow cel 1 lane pe50 | HiSeq快速运行与50 bp配对结束读取长度在一个lane Split Flowcell | 1801美元 | 1350美元 |
| Res his full flowwcell pe100 | HiSeq快速运行与100 bp配对结束读取全流程单元 | 4009美元 | 3006美元 |
| Res split FLW cel2lanes pe100 | HiSeq快速运行与100 bp配对结束读取2车道分裂流量单元 | 4495美元 | 3371美元 |
| Res split FLW cel 1 lane pe100 | HiSeq快速运行与100 bp配对结束读取1通道分裂流量单元 | 2300美元 | 1725美元 |
| 让他充满活力 | HiSeq快速运行与250 bp配对结束读取全流程单元 | 6364 .30美元 | 4773 .23美元 |
| 飞机分成两排，每排250 | HiSeq快速运行与250 bp配对结束读取2车道分裂流量单元 | 6960 .23美元 | 5220美元。 |
| Res split FLW cel 1 lane pe250 | HiSeq快速运行与250 bp配对结束读取1通道分裂流单元 | 3513 .22元 | 2634 .92元 |
| Res杂项CDM | 为我们昂贵的MiSeq & Hi Seq拆分。联系Genomics Core Manager | 变量 |
*会员价格包含25%的补贴。
非英国客户支付标价加10%。
微阵列相关服务价目表
| 服务名称 | 描述 | 英国的价格 | MCC会员价格* |
| Res生物分析dna-1000 | 安吉伦生物分析仪DNA 1000, 1-12个样品，尺寸25-1000 bp，浓度范围0.1-50 ng/ul，需要1-2ul的DNA样品 | 44.02美元 | 33.02美元 |
| Res生物分析dna-hs | DNA高灵敏度，1-11个样品，尺寸50-7000bp，浓度范围5- 500pg /ul，需要1-2ul的DNA样品 | 64.97美元 | 48.73美元 |
| Res生物分析纳米滴 | 使用纳米滴谱仪测定DNA/RNA样品的浓度，需要1-2ul的样品 | 5.15美元 | 3.86美元 |
| Res生物分析rna -纳米 | 安捷伦生物分析仪RNA 6000 RNA纳米试剂盒，1-12个样品，浓度范围25- 500ng /ul，需要1-2ul的RNA样品 | 42.31美元 | 31.73美元 |
| Res生物分析rna-pico | 安吉伦生物分析仪RNA Pico试剂盒，1-11个样品，浓度范围50- 5000pg /ul，需要1-2ul的RNA样品 | 45.17美元 | 33.88美元 |
| Res - mi-rna处理 | 纳米串nCounter的miRNA处理，12个样品，请联系实验室了解浓度要求 | 155.00美元 | 116.25美元 |
| Res RNA处理 | RNA处理Nanostring nCounter系统，12个样品，如有浓度要求请联系实验室 | 85.00美元 | 63.75美元 |
| Res数组/ pico wt协议 | Affymetrix HTA阵列加上Pico WT处理 | 609.85美元 | 457.39美元 |
| Res基因阵列/ pico wt协议 | Affymetrix基因阵列加上Pico WT处理 | 556.00美元 | 417.00美元 |
| 额外基因阵列 | 仅Affymetrix基因阵列 | 225.00美元 | 168.75美元 |
| Res extra ht数组 | 仅Affymetrix HTA阵列 | 299.00美元 | 224.25美元 |
| Res mirna过程和阵列 | Affymetrix miRNA阵列加处理 | 375.00美元 | 281.25美元 |
| Res mirna process | Affymetrix miRNA处理 | 190.96美元 | 143.22美元 |
| Res 3'ivt处理 | 仅Affymetrix 3' IVT处理 | 290.00美元 | 217.50美元 |
| Res wt处理 | Affymetrix WT处理 | 294.00美元 | 220.50美元 |
| Res pico-wt处理 | Affymetrix Pico WT处理 | 331.00美元 | 248.25美元 |
| Res牛基因1.0 st阵列 | Affymetrix牛基因1.0阵列加处理 | 525.00美元 | 393.75美元 |
| 秀丽隐杆线虫基因1.0集 | Affymetrix C. Elegans基因1.0阵列加上处理 | 525.00美元 | 393.75美元 |
| 保存人类基因1.0 st阵列 | Affymetrix人类基因1.0 ST阵列加处理 | 525.00美元 | 393.75美元 |
| Res人类基因2.0 st阵列 | Affymetrix人类基因2.0 ST阵列加处理 | 525.00美元 | 393.75美元 |
| Res小鼠基因1.0 st阵列 | Affymetrix小鼠基因1.0 ST阵列加处理 | 525.00美元 | 393.75美元 |
| Res小鼠基因2.0 st阵列 | Affymetrix小鼠基因2.0 ST阵列加处理 | 525.00美元 | 393.75美元 |
| Res大鼠基因1.0 st阵列 | Affymetrix大鼠基因1.0 ST阵列加处理 | 525.00美元 | 393.75美元 |
| Res大鼠基因2.0 st阵列 | Affymetrix大鼠基因2.0 ST阵列加处理 | 525.00美元 | 393.75美元 |
| Res human hta 2.0阵列 | Affymetrix Human hta2.0阵列加处理 | 599.00美元 | 449.25美元 |
| Res鼠标mta 1.0阵列 | Affymetrix Mouse mta1.0阵列加处理 | 599.00美元 | 449.25美元 |
| Res rat mta 1.0阵列 | Affymetrix Rat rta1.0阵列加处理 | 599.00美元 | 449.25美元 |
*会员价格包含25%的补贴。
非英国客户支付标价加10%。
联系方式及地点
beplay首页英国医疗保健基因组学核心实验室
英国艾伯特B.钱德勒医院- HA馆
房间HA629
玫瑰街800号
beplay苹果下载网址莱克星顿KY 40536-0293
调用859-323-5327
调用859-323-5984
genomics@uky.edu
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